口腔扁平苔藓的病因暂不明确，可能由多种因素导致，比如精神心理因素、免疫学因素、内分泌因素、感染因素、遗传因素、系统病因素以及一些微循环障碍，微量元素异常等其他因素都可以引起。此病情好发于绝经前后的女性、罹患基础病变的人和营养不良的人，同时精神压力过大、内分泌失调以及服用药物都可能诱发。
一、主要病因1、精神心理因素：临床观察到口腔扁平苔藓的发病与精神心理因素有关，多数学者也承认心理因素如过分焦虑、精神紧张、失眠等是其重要病因之一。2、内分泌因素：本病的病情与妊娠、更年期以及一些影响内分泌功能的药物有关。患者雌二醇、睾酮含量常低于常人，更年期妇女有病情加重的倾向，妊娠妇女有减轻或消退的现象，再来月经时可以重复发作。3、免疫因素：口腔扁平苔藓是一种局限性的自身免疫疾病，是一种由T细胞介导的机体免疫应答状态。它的发病机制与免疫有密切关系，疾病的发生，可能有多种免疫活性细胞、细胞因子的参与。4、系统病因素：不少口腔扁平苔藓患者发病及病情发展与某些全身疾病有关，如糖尿病、慢性肝炎、高血压、消化系统功能紊乱等。5、感染因素：20世纪60年代以来，本病与微生物的关系进行了许多研究，提出过病毒感染以及细菌感染学说，但均未得到证实。6、遗传因素：本病有家族遗传倾向，研究发现女性家族成员中遗传给后代者较多。7、其他因素：口腔扁平苔藓患者体内常可发现维生素的缺乏，微量元素锌、碘低于正常，镍高于正常；此外，扁平苔藓病人的甲皱、眼结膜还伴有微血管的变化。
二、诱发因素1、精神压力过大：口腔扁平苔藓的发病与社会、家庭、工作生活承受的压力过大，以及个人心理异常等有关。2、内分泌失调：本病女性患者多见，与更年期、妊娠期有关，妊娠时病情缓解，月经恢复后又复发。3、药物：服用多巴胺类中枢性降压药、氯喹啉、异喹啉等之后，口腔内可能会出现扁平苔藓之类的改变或可使原来的苔藓症状加重的表现。口腔粘膜扁平苔藓要根据病因对症用药治疗，平时饭前饭后要用漱口水漱口，有消炎杀菌的功效，保证口腔卫生有利于治疗，可以使用胃酸类药物，口服免疫力药，提高身体抵抗力，也有助于治疗，饮食可以吃一些含B族维生素多的食物，千万不要吃刺激性食物。